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澳门赌博游戏平台牧草課題組公佈我國第一個牧草(鴨茅)基因組

點擊數:2019-07-08 08:52:22 来源:澳门赌博游戏平台

最近 ,澳门赌博游戏平台動物科學與技術澳门赌博游戏平台牧草研究小組在植物學權威雜誌《Plant Biotechnology Journal》上發表了題爲《Genome assembly provides insights into the genome evolution and flowering regulation of orchardgrass》的研究論文,這是第一個發表高質量參考基因組的研究論文 。高品質的草和草,是一種浮萍分子。育種提供了重要的基礎信息支持,這是中國出版的第一個牧草參考基因組。

動態科學澳门赌博游戏平台的黃林泰教授是第一作者,博士。學生馮光豔,嚴海東和諾志遠張忠仁是共同的第一作者。張新泉教授是交流的作者。 Nuohe Zhiyuan博士蔣文凱是通信的合着者,川農是第一個單位 。第一位通訊作者 ,美國農業部牧草和草地資源研究實驗室的研究員Shaun Bushman ,弗吉尼亞理工大學的Aure博士和佛羅里達大學的王江平副教授參加了這項研究 。《Plant Biotechnology Journal》是中國科澳门赌博游戏平台在生物科學和植物科學領域的區域性雜誌。影響因子在2019年爲6.8,在農學和作物科學中排名第一  。

Dactylis glabra是一種優質多年生草本牧草 ,廣泛用於歐洲 ,北美洲 ,大洋洲和中國西南部。它是世界上四種廣泛分佈的草之一 。然而,由於Dactylis glomerata基因組的高重現性和高雜合性,Dactylis glabra的參考基因組多年來一直沒有。本研究選擇二倍體Dactylis glabra作爲研究對象。第二代和第三代測序策略與Hi-C染色體構象捕獲技術 ,BioNano光學圖譜和10X Genomics技術相結合 ,首次完成了D. argyi基因組的測序和組裝 。在該研究中獲得的空心蓮子草的基因組大小爲約1.84Gb,重疊羣N50爲0.93Mb,並且支架N50爲6.08Mb 。共鑑定了40,088個蛋白質編碼基因,在草類植物基因組研究領域處於領先水平。序列分析表明,69%的果蠅基因組剪接基因組序列是轉座子,長末端重複序列(LTRs)佔最多。據推測,LTRs可能在D. sinensis基因組中擴增 ,以適應一百萬年前的活力。環境變化。在這項研究中,BSA ,轉錄測序和QTL定位技術相結合,以確定控制開花性狀的四個潛在調控基因,這爲有針對性地選擇農藝性狀提供了新的線索 。

全文鏈接:https://onlinelibrary.wiley.com/doi/pdf/10.1111/pbi.13205